75883 E2021 UL KLM AMG Utstyr til NIPT Hardware- software-reagenser - Med delkontrakter

Avdeling for medisinsk genetikk, ous, skal anskaffe hardware/software og reagenser til Non-Invasive Prenatal Test (nipt)-metode basert på high throughput sequencing (hts)/next generation sequencing. Anskaffelsen omfatter software/hardware og etableringskostander for nipt Veriseq v2. i tillegg skal anskaffelsen omfatte et tilbud på pris per test (inkl. Reagensutgifter). Anskaffelsen omfatter ikke sekvenseringsinstrument, da avdelingens NextSeq500-instrumenter skal benyttes.
Behovet for rask implementering av nipt kom etter at Stortinget vedtok ny Bioteknologilov den 26. 5. 20, med virking fra 1. 7. 20.
Anskaffelsen omfatter også inngåelse av rammeavtale for kjøp av utstyrsspesifikke forbruksvarer. Rammeavtalen er løpende og gjelder så lenge minst et instrument er i bruk. For rammeavtalene gjelder opsjonene beskrevet i vedlegg 4. 1. Tildeling av avtale på forbruksvarer vil følge tildelingen av avtale på kjøp av instrument
Metoden har noen a-krav som er viktig for analysekvalitet og logistikk:
- Analysen må ha kapasitet til 96 prøver per kjøring, men være fleksibel til også å analysere et færre antall. Lav totalttid for analysen, samt begrenset hands-on time, er viktig.
- For hver prøve må det være fleksibelt om laboratoriet skal analysere for kun T21, T18, T13, eller om også kjønnskromosomer og/eller større kopitallsavvik (ca. > 7MB) skal analyseres.
- Hardware og software og reagenser som anskaffes skal sammen med kompatibel pipetteringsrobot skape en strømlinjeformet arbeidsflyt fra blodprøve til ferdig svarrapport som leverandør skal være ansvarlig for å sette opp. Sekvenseringen må utføres med next generation sequencing paired-end reads (ngs) på instrumenter som allerede finnes ved avdelingen, dvs. En Illumina-platform (e. g. NextSeq500).
- Metoden må inkludere måling av føtal fraksjon i dna-prøven.
- Softwaret må kunne analysere dataene rådataene og ferdigstille en rapport per pasient, samt generere standard out-put filer som fastaq.
- Det må finnes ferdig validert protokoll tilgjengelig på pipetteringsrobot som skal anskaffes (egen intensjonskunngjøring). Antatt forbruk første driftsår vil avhenge av om de andre universitetssykehusene etablerer samme tilbud. Det forventes at tilbyder kan gi en pris ut fra forventet prøvemengde til medisinsk genetiske avdelinger ved norske universitetssykehus. Det er ønskelig med pris for driftsutgifter med ulikt forventet prøvetilsig, dvs. Intervaller mellom.
Forbehold om finansiering.