75883 E2021 UL KLM Avdeling for medisinsk genetikk Utstyr til NIPT Pipetteringsrobot - Med delkontrakter

Avdeling for medisinsk genetikk, ous, skal anskaffe Veriseq nipt Microlab Star pipetteringsrobot for prøvepreparering til Non-Invasive Prenatal Test (nipt)-metode basert på high throughput sequencing (hts)/next generation sequencing. Anskaffelsen omfatter pipetteringsrobot med ferdig installert pipetteringsprogram for protokollen VeriSeq nipt Solution v2 og robot dekket skal inkludere alt utstyr som er nødvendig for å kjøre protokollen. i tillegg må tillegsutstyr være inkludert i prisen. i tillegg skal anskaffelsen omfatte et tilbud på pris per test for utstyrsspesifikke forbruksvarer knyttet til pipetteringsroboten (dvs. Pipettespisser). Behovet for implementering av nipt kom etter at Stortinget vedtok ny Bioteknologilov den 26. 5. 20, med virkning fra 1. 7. 20.
Anskaffelsen omfatter også inngåelse av rammeavtale for kjøp av utstyrsspesifikke forbruksvarer. Rammeavtalen er løpende og gjelder så lenge minst et instrument er i bruk. For rammeavtalene gjelder opsjonene beskrevet i vedlegg 4. 1. Tildeling av avtale på forbruksvarer vil følge tildelingen av avtale på kjøp av instrument
Instrumentet og metoden har noen a-krav som er viktig for analysekvalitet og logistikk:
- Instrumentet må leveres med validert protokoll for metoden Veriseq nipt v2.
- Instrumentet må ha kapasitet til 96 prøver per kjøring, men være fleksibel til også å preparere et færre antall. Lav totalttid for analysen, samt begrenset hands-on time, er viktig.
- For hver prøve må det være fleksibelt om laboratoriet skal analysere for kun T21, T18, T13, eller om også kjønnskromosomer og/eller større kopitallsavvik (ca. > 7MB) skal analyseres.
- Pipetteringsroboten som anskaffes skal sammen med hardware, software og reagenser for Veriseq nipt v2 (egen intensjonskunngjøring) skape en strømlinjeformet arbeidsflyt fra blodprøve til ferdig svarrapport som leverandør skal være ansvarlig for å sette opp. Sekvenseringen må utføres med next generation sequencing paired-end reads (ngs) på instrumenter som allerede finnes ved avdelingen, dvs. En Illumina-platform (e. g. NextSeq500).
- Metoden må inkludere måling av føtal fraksjon i dna-prøven.
- Metoden må ha et ferdig utviklet software som kan analysere dataene rådataene og ferdigstille en rapport per pasient, samt generere standard out-put filer som fastaq.
- Roboten må kunne håndtere Streck cellefritt dna-blodprøverør (bct), samt kunne ekstrahere cfDNA fra plasma.
- Roboten skal leveres med 96-hode med utbyttbare spisser, og minimum 8-kanals pipette med individuell styring, ha barkodelesere, samt dekktilbehør- og utforming, og ekstrautstyr som er nødvendig for protokollen Veriseq nipt v2.
- Antatt forbruk første driftsår vil avhenge av om de andre universitetssykehusene etablerer samme tilbud. Det forventes at tilbyder kan gi en pris ut fra forventet prøvemengde til medisinsk genetiske avdelinger ved norske universitetssykehus. Det er ønskelig med pris for utstyrsspesifikke driftsutgifter (e. g. Pipettespisser) med ulikt forventet prøvetilsig, dvs. Intervaller mellom 3000 - 30 000 prøver totalt.
Det tas forbehold om finansiering.