Instrument for high-throughput og høyoppløselig spatial analyse av proteiner og genuttrykk

Institutt for kreftforskning, en del av Institutt for klinisk medisin, Universitetet i Oslo, ønsker å anskaffe et instrument for high-throughput og høyoppløselig spatial analyse av proteiner og genuttrykk. Dette systemet vil bli brukt i grunn- og translasjonsforskning ved Universitetet i Oslo og Oslo universitetssykehus. Denne teknologien muliggjør profilering av celletypespesifikke morfologimarkører samt påvisning av funksjoner til ulike og sjeldne cellepopulasjoner eller spatiale vevsforskjeller, heterogenitet.
Spesifikasjoner: mÅ-krav. Disse kravene må oppfylles.
• Systemet må kunne visualisere morfologiske detaljer med høy oppløsning ved hjelp av konvensjonelle immunfluorescensteknikker for å kunne selektere områder av interesse fra samme vevsseksjon hvor høy-plex profilering av proteiner eller genuttrykk vil bli utført.
• Systemet må tillate brukerdefinerte områder av interesse og gi mulighet for utvelgelse fra titalls til hundretalls områder av interesse per vevsseksjon.
• Systemet skal være kompatibelt med analyse av vevssnitt fra ffpe og ferskfrosset vev.
• Systemet må kunne analysere flere analytter fra et enkelt vevssnitt, som for eksempel proteiner og rna (genuttrykk).
• Systemet skal kunne kvantifisere over 96 proteiner og/eller over 18 000 rna i et enkelt vevssnitt, som inkluderer pre-definerte, pre-validerte og optimaliserte gen- og protein paneler.
• Det må være mulig å gjennomføre målinger av individuelle rna og protein molekyler ved bruk av systemet. Resultatene må kunne gis som digital output.
• Systemet må kunne kvantifisere analytter basert på lineær enkeltmolekyletelling: opptil 5, 5 logger (base 10)
• Systemet må være kompatibelt med standard NanoString nCounter og Illumina ngs teknologi som avlesningsplattformer
• Systemet skal ikke ødelegge prøven. Prøven må være intakt etter analysen for videre analyse.
Tilbakemelding fra leverandører. Leverandører som kan levere utstyr som oppfyller nevnte funksjonalitet og spesifikasjoner bes kontakte Sven-Christopher Aalvik innen utløp av karenstiden. Dokumentasjon på oppfyllelse av spesifikasjoner sendes til (info fjernet). Skulle det i løpet av karenstiden ikke fremkomme opplysninger om aktuelle alternativer vil vi inngå avtale med nanoString.