Intensjonskunngjøring - Custom 70K SNP-genotypingsarray for gråspurv

Intensjonskunngjøres ref. §13-4b)1: i forbindelse med to eksternfinansierte forskningsprosjekter (nfr og Royal Society) skal det utføres snp-genotyping av over 8000 gråspurver fra en langtidsstudie på Helgelandskysten. Tidligere har vi snp-genotypa 4000 individer fra samme studie på en custom 200K Axiom snp-array (Thermo Fisher Scientific), og vi vil nå genotype ytterligere 8000 individer på 70000 av disse 200000 SNPene for å få et kombinert datasett som inkluderer 12000 individer genotypa på 70K av de samme SNPene. At alle disse individene er genotypa på de samme SNPene er helt nødvendig for å kunne gjennomføre forskningsprosjektene våre. Fordi ulike snp-genotypingsplattformer ikke gir direkte sammenlignbare
resultater, er den eneste muligheten for å få til dette at vi bestiller et nytt custom 70K Axiom snp-array fra Thermo Fisher Scientific, der dette arrayet må inneholde snp-prober for et nøye utvalgt subset av probene vi hadde på vårt 200K Axiom snp-array.