Ultrasonicator - Med delkontrakter

Universitetet i Oslo, Avdeling for klinisk molekylærbiologi (EpiGen), vil anskaffe en ultrasonicator som i hovedsak skal benyttes til høyspesifikk klipping av dna/rna/kromatin fra ulike kilder. Dette er et nødvendig trinn før neste generasjonssekvensering. i tillegg skal maskinen benyttes til «Acoustic Paraffin Emulsification» av nukleinsyrer fra Formalin-fixed paraffin-embedded (ffpe) prøver og til celle- og vev lysering. Vi kjenner ikke til andre instrumenter på markedet som kan i tillegg til høyspesifikt fragmentering av dna/rna/kromatin, også utføre de andre ovennevnte funksjonene. Disse kravene må oppfylles.
Spesifikasjoner: mÅ-krav. Disse kravene må oppfylles.
• Systemet må kunne klippe dna/rna/kromatin med veldig høyspesifikt fragmentering.
• Systemfrekvensen må være fokusert og gi rask og kontinuerlig prøvebehandling uten utvikling av betydelig varme i prøven under prosessering. Dette er viktig for å opprettholde integriteten til nukleinsyrene / kromatinet for nedstrøms analyse.
• Systemet må kunne lysere ulike celler og typer av vev (pattedyr, bakterier, gjær)
• Systemet må kunne brukes til ekstraksjon av cellefri dna fra plasma
• Systemet må kunne brukes til ekstraksjon av dna fra tørkete blodflekker
• Systemet må kunne benyttes til ekstraksjon av dna/rna/protein fra ffpe-prøver ved bruk avultralyd
• Systemet må oppfylle krav for “multi-sample batch preparation” og skal være i stand til å prosessere 1-96 prøver og ulike prøvevolumer i en kjøring
• Systemet må ikke kreve hørselvern og skal kunne brukes i en generell laboratoriesetting