18/02382 DNA sekvenseringsmaskin for Sanger sekvensering - Med delkontrakter

Havforskningsinstituttets genetikklaboratorium i Tromsø planlegger å anskaffe en ny dna sekvenseringsmaskin for Sanger sekvensering. Denne maskinen skal erstatte vår utgående abi 3130 xl. Maskinen skal brukes til Sanger sekvensering av pcr produkt, samt fragmentanalyse med fluorescens merkete primere. For å ivareta opparbeidede tidsserier for fragment (mikrosatelitt data) må fragmentanalysene være sammenlignbare med data fra instrumentet som skal erstattes.
Minimumskrav:
- Skal være mulig til å bruke instrumentet til sanger sekvensering og fragment analyse av fluorescens merkede pcr produkter via kapillær elektroforese.
- Skal kunne analysere fragmenter opp til 700 baser (sekvensering) og 500 baser (fragment).
- Pga. Antall prøver som analyseres må instrumentet ha minimum 8 kapillærer.
- Skal være kompatibel til 96- brønn format.
- Skal være direkte kompatibelt med Applied Biosystems 5 - farge kjemi (filter sett G5) for fluorescens merkete primere.
- Skal leveres med programvare for å behandle rådata fra sekvenseringsmaskinen.
- Skal kunne kjøre fragmentanalyse og sekvensering på samme plate.
- Teknisk og bioinformatisk støtte må være inkludert, samt analyse programvare med minimum 3 lisenser for både sekvenseringsdata og fragmentdata.