19/02675 Automatisert væskehåndteringssystem med metodetilpasset DNA-ekstraksjon

Havforskningsinstituttet (hi) utfører dna-ekstraksjon og molekylære analyser på et stort antall og spekter av prøver. Prøvespekteret omfatter både stor diversitet i arter, men også stor variasjon på mengde tilgjengelig prøve (for eksempel gjelder dette nylig befruktede fiskeegg). Utarbeiding og etablering av nye metoder innen genetikk og genomikk, samtidig som metodene ønskes anvendt som verktøy i stadig flere prosjekter, gjør automatisering uunngåelig. For å håndtere et tidvis stort antall prøver på tilgjengelig plass, trengs ett system for væskehåndtering for både dna-ekstraksjon og komplekse pipetteringsapplikasjoner. hi har derfor til hensikt å gå til anskaffelse av Hamilton Microlab star Liquid Handling System, konfigurert for Omega Bio-tek Mag-Bind®-kjemi. Dette er et skreddersydd samarbeid levert av vwr, og inkluderer service og applikasjonsstøtte. vwr anses som eneste totalleverandør med mulighet for å levere til vårt behov. Anskaffelsen inkluderer rammeavtale for instrumentspesifikke forbruksvarer.
nærmere krav som stilles til det automatiserte væskehåndteringssystemet:
· på grunn av begrenset plasstilgang og behov for flere komplekse pipetteringsoppgaver må anskaffelsen bestå av ett samlet system for dna-ekstraksjon og andre pipetteringsapplikasjoner. Systemet må leveres med egne ben/på tilpasset bord.
· væskehåndteringssystemet skal benytte «air displacement»-teknologi, siden dette krever mindre vedlikehold, og er mindre ergonomisk belastende enn opplegg med systemvæske. Det er også behov for trykksensor-system (ved både disp. Og asp.), for eksempel for å unngå drypp ved pipettering av væsker med lav viskositet.
· Pipetterbart volum per syklus skal være i området 1-1000µl for alle kanaler. Pipetteringsmodulen skal inneholde et 96-hode, pluss 8-kanaler med asymmetrisk spredning, sistnevnte med separat voluminnstilling.
· Systemet skal kunne prosessere dna-ekstraksjon fra fire 96-brønners brett per run. Outputvolumet må kunne tas ned fra 200 til 20µl.
· Systemet skal ha integrert barkodeleser for plater.
· Systemet skal i tillegg kunne settes opp med tilpassede applikasjoner for «cherry-picking», normalisering, «bead clean-up» og pcr-oppsett
· Det må gjøres forhåndsvalidering av metode utført direkte av kit-leverandør og videre «on site» implementering av disse. Ettersom en del av prøvematerialet har svært lav dna-konsentrasjon og lite volum (for eksempel fiskeegg i tidlig utviklingsstadium), må metode også tilpasses for dette.