75696 E2020 KRE Institutt for kreftgenetikk og informatikk Array Scanner

Seksjon for kreftcytogentikk ved Oslo universitetssykehus søker etter et presist og effektivt mikroarray-skannersystem for diagnostiske (info fjernet) bruker i økende grad mikroarray-metodikk som rutinemessig diagnostikk. Fra 2019 har denne metoden blitt en obligatorisk diagnostisk analyse for studien av flere leukemier, dvs. all og aml. Seksjonen, som allerede utfører analysen for pasienter i vår institusjon (ous-hf) samt leukemier fra andre institusjoner, vil i fremtiden utføre denne analysen for flere pasienter. Med dette som bakgrunn, må vi øke skannerkapasiteten uten å endre chip vi bruker for tiden. Disse chips er spesialdesignet for å dekke genene / regionene av interesse beskrevet i nopho-protokollen All2Gether for all. Skanneren skal ha en laser-indusert fluorescens-skanningsløsning designet for å lese mikroarrayer trykt på standard 1 tommer med 3 tommers glassglass, med en oppløsning på minst 2 um. Instrumentet skal også måle fluorescensintensiteten til to fargestoffer (~ 532nm og ~ 633nm) samtidig fra merket prøvenukleinsyre bundet til mikroarrays. Systemet skal øke produktiviteten med kontinuerlig lasting fra minst 24-lysbildekassett og automatisk innlasting av datafiler til en analyseprogramvare. Det er en positiv egenskap hvis instrumentet er bygd som en ozonbeskyttelsesmåte" for å minimere signalforringelse. Avdelingen foretrekker skanning av med ogt teknologi og ogt slides.